Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nme8Q715T0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nme8Q715T0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nme8Q715T0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nme8Q715T0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nme8Q715T0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nme8Q715T0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nme8Q715T0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nme8Q715T0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nme8Q715T0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nme8Q715T0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nme8Q715T0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nme8Q715T0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nme8Q715T0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nme8Q715T0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nme8Q715T0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nme8Q715T0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nme8Q715T0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nme8Q715T0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nme8Q715T0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nme8Q715T0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nme8Q715T0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nme8Q715T0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nme8Q715T0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nme8Q715T0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nme8Q715T0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nme8Q715T0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Nme8Q715T0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Nme8Q715T0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nme8Q715T0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nme8Q715T0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nme8Q715T0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nme8Q715T0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nme8Q715T0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nme8Q715T0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nme8Q715T0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nme8Q715T0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nme8Q715T0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nme8Q715T0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Nme8Q715T0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nme8Q715T0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nme8Q715T0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nme8Q715T0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nme8Q715T0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nme8Q715T0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nme8Q715T0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nme8Q715T0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nme8Q715T0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Nme8Q715T0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nme8Q715T0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nme8Q715T0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nme8Q715T0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nme8Q715T0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nme8Q715T0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nme8Q715T0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nme8Q715T0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nme8Q715T0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nme8Q715T0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nme8Q715T0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nme8Q715T0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nme8Q715T0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nme8Q715T0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nme8Q715T0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nme8Q715T0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nme8Q715T0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nme8Q715T0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nme8Q715T0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nme8Q715T0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms