Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00173Q6ZV60 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC00173Q6ZV60 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00173Q6ZV60 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.1 ms