Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
LRRC9Q6ZRR7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
LRRC9Q6ZRR7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
LRRC9Q6ZRR7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
LRRC9Q6ZRR7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
LRRC9Q6ZRR7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
LRRC9Q6ZRR7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
LRRC9Q6ZRR7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
LRRC9Q6ZRR7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
LRRC9Q6ZRR7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
LRRC9Q6ZRR7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
LRRC9Q6ZRR7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
LRRC9Q6ZRR7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
LRRC9Q6ZRR7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
LRRC9Q6ZRR7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
LRRC9Q6ZRR7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
LRRC9Q6ZRR7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
LRRC9Q6ZRR7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
LRRC9Q6ZRR7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
LRRC9Q6ZRR7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
LRRC9Q6ZRR7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
LRRC9Q6ZRR7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
LRRC9Q6ZRR7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
LRRC9Q6ZRR7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
LRRC9Q6ZRR7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
LRRC9Q6ZRR7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
LRRC9Q6ZRR7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
LRRC9Q6ZRR7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
LRRC9Q6ZRR7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
LRRC9Q6ZRR7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
LRRC9Q6ZRR7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
LRRC9Q6ZRR7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
LRRC9Q6ZRR7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
LRRC9Q6ZRR7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
LRRC9Q6ZRR7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
LRRC9Q6ZRR7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
LRRC9Q6ZRR7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
LRRC9Q6ZRR7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
LRRC9Q6ZRR7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
LRRC9Q6ZRR7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
LRRC9Q6ZRR7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
LRRC9Q6ZRR7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
LRRC9Q6ZRR7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
LRRC9Q6ZRR7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
LRRC9Q6ZRR7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
LRRC9Q6ZRR7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
LRRC9Q6ZRR7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
LRRC9Q6ZRR7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC38.16■■■■□ 3.7
LRRC9Q6ZRR7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
LRRC9Q6ZRR7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
LRRC9Q6ZRR7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
LRRC9Q6ZRR7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
LRRC9Q6ZRR7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
LRRC9Q6ZRR7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
LRRC9Q6ZRR7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
LRRC9Q6ZRR7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
LRRC9Q6ZRR7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
LRRC9Q6ZRR7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
LRRC9Q6ZRR7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
LRRC9Q6ZRR7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC38.14■■■■□ 3.7
LRRC9Q6ZRR7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
LRRC9Q6ZRR7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
LRRC9Q6ZRR7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
LRRC9Q6ZRR7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
LRRC9Q6ZRR7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
LRRC9Q6ZRR7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
LRRC9Q6ZRR7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
LRRC9Q6ZRR7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
LRRC9Q6ZRR7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
LRRC9Q6ZRR7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
LRRC9Q6ZRR7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
LRRC9Q6ZRR7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
LRRC9Q6ZRR7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
LRRC9Q6ZRR7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
LRRC9Q6ZRR7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
LRRC9Q6ZRR7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
LRRC9Q6ZRR7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
LRRC9Q6ZRR7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
LRRC9Q6ZRR7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
LRRC9Q6ZRR7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
LRRC9Q6ZRR7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
LRRC9Q6ZRR7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
LRRC9Q6ZRR7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
LRRC9Q6ZRR7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
LRRC9Q6ZRR7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
LRRC9Q6ZRR7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
LRRC9Q6ZRR7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
LRRC9Q6ZRR7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
LRRC9Q6ZRR7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
LRRC9Q6ZRR7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
LRRC9Q6ZRR7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
LRRC9Q6ZRR7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
LRRC9Q6ZRR7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
LRRC9Q6ZRR7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
LRRC9Q6ZRR7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
LRRC9Q6ZRR7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
LRRC9Q6ZRR7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
LRRC9Q6ZRR7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
LRRC9Q6ZRR7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms