Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ58

Larp1, La-related protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1Q6ZQ58 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Larp1Q6ZQ58 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Larp1Q6ZQ58 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Larp1Q6ZQ58 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Larp1Q6ZQ58 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Larp1Q6ZQ58 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Larp1Q6ZQ58 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Larp1Q6ZQ58 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Larp1Q6ZQ58 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Larp1Q6ZQ58 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Larp1Q6ZQ58 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Larp1Q6ZQ58 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Larp1Q6ZQ58 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Larp1Q6ZQ58 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Larp1Q6ZQ58 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Larp1Q6ZQ58 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Larp1Q6ZQ58 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Larp1Q6ZQ58 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Larp1Q6ZQ58 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Larp1Q6ZQ58 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Larp1Q6ZQ58 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Larp1Q6ZQ58 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Larp1Q6ZQ58 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Larp1Q6ZQ58 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Larp1Q6ZQ58 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Larp1Q6ZQ58 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Larp1Q6ZQ58 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Larp1Q6ZQ58 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Larp1Q6ZQ58 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Larp1Q6ZQ58 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Larp1Q6ZQ58 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Larp1Q6ZQ58 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Larp1Q6ZQ58 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Larp1Q6ZQ58 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Larp1Q6ZQ58 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Larp1Q6ZQ58 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Larp1Q6ZQ58 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Larp1Q6ZQ58 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Larp1Q6ZQ58 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Larp1Q6ZQ58 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Larp1Q6ZQ58 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Larp1Q6ZQ58 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Larp1Q6ZQ58 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Larp1Q6ZQ58 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Larp1Q6ZQ58 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Larp1Q6ZQ58 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Larp1Q6ZQ58 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Larp1Q6ZQ58 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Larp1Q6ZQ58 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Larp1Q6ZQ58 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Larp1Q6ZQ58 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Larp1Q6ZQ58 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Larp1Q6ZQ58 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Larp1Q6ZQ58 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Larp1Q6ZQ58 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Larp1Q6ZQ58 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Larp1Q6ZQ58 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Larp1Q6ZQ58 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Larp1Q6ZQ58 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Larp1Q6ZQ58 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms