Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ38

Cand1, Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cand1Q6ZQ38 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cand1Q6ZQ38 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cand1Q6ZQ38 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms