Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot1Q6ZQ08 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot1Q6ZQ08 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot1Q6ZQ08 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot1Q6ZQ08 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot1Q6ZQ08 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnot1Q6ZQ08 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnot1Q6ZQ08 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnot1Q6ZQ08 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnot1Q6ZQ08 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnot1Q6ZQ08 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnot1Q6ZQ08 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnot1Q6ZQ08 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnot1Q6ZQ08 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnot1Q6ZQ08 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnot1Q6ZQ08 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnot1Q6ZQ08 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnot1Q6ZQ08 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnot1Q6ZQ08 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnot1Q6ZQ08 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnot1Q6ZQ08 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnot1Q6ZQ08 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnot1Q6ZQ08 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnot1Q6ZQ08 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnot1Q6ZQ08 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnot1Q6ZQ08 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnot1Q6ZQ08 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnot1Q6ZQ08 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnot1Q6ZQ08 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnot1Q6ZQ08 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnot1Q6ZQ08 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnot1Q6ZQ08 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnot1Q6ZQ08 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnot1Q6ZQ08 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnot1Q6ZQ08 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnot1Q6ZQ08 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnot1Q6ZQ08 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot1Q6ZQ08 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot1Q6ZQ08 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot1Q6ZQ08 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot1Q6ZQ08 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot1Q6ZQ08 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot1Q6ZQ08 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnot1Q6ZQ08 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnot1Q6ZQ08 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnot1Q6ZQ08 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnot1Q6ZQ08 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnot1Q6ZQ08 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnot1Q6ZQ08 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot1Q6ZQ08 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot1Q6ZQ08 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot1Q6ZQ08 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot1Q6ZQ08 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot1Q6ZQ08 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot1Q6ZQ08 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot1Q6ZQ08 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot1Q6ZQ08 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot1Q6ZQ08 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot1Q6ZQ08 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot1Q6ZQ08 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot1Q6ZQ08 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot1Q6ZQ08 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot1Q6ZQ08 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms