Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NFXL1Q6ZNB6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NFXL1Q6ZNB6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NFXL1Q6ZNB6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NFXL1Q6ZNB6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NFXL1Q6ZNB6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NFXL1Q6ZNB6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NFXL1Q6ZNB6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NFXL1Q6ZNB6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NFXL1Q6ZNB6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NFXL1Q6ZNB6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NFXL1Q6ZNB6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFXL1Q6ZNB6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFXL1Q6ZNB6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFXL1Q6ZNB6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFXL1Q6ZNB6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFXL1Q6ZNB6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFXL1Q6ZNB6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NFXL1Q6ZNB6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFXL1Q6ZNB6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFXL1Q6ZNB6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFXL1Q6ZNB6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFXL1Q6ZNB6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFXL1Q6ZNB6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFXL1Q6ZNB6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFXL1Q6ZNB6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFXL1Q6ZNB6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFXL1Q6ZNB6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFXL1Q6ZNB6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NFXL1Q6ZNB6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NFXL1Q6ZNB6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFXL1Q6ZNB6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.3 ms