Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MUC6Q6W4X9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MUC6Q6W4X9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MUC6Q6W4X9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MUC6Q6W4X9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MUC6Q6W4X9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MUC6Q6W4X9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MUC6Q6W4X9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MUC6Q6W4X9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MUC6Q6W4X9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MUC6Q6W4X9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MUC6Q6W4X9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MUC6Q6W4X9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MUC6Q6W4X9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MUC6Q6W4X9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MUC6Q6W4X9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MUC6Q6W4X9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MUC6Q6W4X9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MUC6Q6W4X9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MUC6Q6W4X9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MUC6Q6W4X9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MUC6Q6W4X9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MUC6Q6W4X9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MUC6Q6W4X9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MUC6Q6W4X9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MUC6Q6W4X9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MUC6Q6W4X9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MUC6Q6W4X9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MUC6Q6W4X9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MUC6Q6W4X9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MUC6Q6W4X9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms