Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD4L3Q6VB84 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD4L3Q6VB84 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD4L3Q6VB84 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD4L3Q6VB84 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD4L3Q6VB84 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD4L3Q6VB84 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD4L3Q6VB84 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD4L3Q6VB84 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FOXD4L3Q6VB84 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXD4L3Q6VB84 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXD4L3Q6VB84 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXD4L3Q6VB84 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXD4L3Q6VB84 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXD4L3Q6VB84 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOXD4L3Q6VB84 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOXD4L3Q6VB84 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOXD4L3Q6VB84 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FOXD4L3Q6VB84 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FOXD4L3Q6VB84 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FOXD4L3Q6VB84 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FOXD4L3Q6VB84 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FOXD4L3Q6VB84 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD4L3Q6VB84 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD4L3Q6VB84 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD4L3Q6VB84 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXD4L3Q6VB84 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXD4L3Q6VB84 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXD4L3Q6VB84 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FOXD4L3Q6VB84 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD4L3Q6VB84 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD4L3Q6VB84 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD4L3Q6VB84 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD4L3Q6VB84 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD4L3Q6VB84 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD4L3Q6VB84 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD4L3Q6VB84 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD4L3Q6VB84 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD4L3Q6VB84 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD4L3Q6VB84 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD4L3Q6VB84 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD4L3Q6VB84 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD4L3Q6VB84 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD4L3Q6VB84 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD4L3Q6VB84 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD4L3Q6VB84 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD4L3Q6VB84 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD4L3Q6VB84 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD4L3Q6VB84 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD4L3Q6VB84 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXD4L3Q6VB84 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXD4L3Q6VB84 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
FOXD4L3Q6VB84 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD4L3Q6VB84 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD4L3Q6VB84 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD4L3Q6VB84 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD4L3Q6VB84 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD4L3Q6VB84 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD4L3Q6VB84 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD4L3Q6VB84 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD4L3Q6VB84 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD4L3Q6VB84 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD4L3Q6VB84 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD4L3Q6VB84 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD4L3Q6VB84 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXD4L3Q6VB84 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXD4L3Q6VB84 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXD4L3Q6VB84 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXD4L3Q6VB84 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXD4L3Q6VB84 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXD4L3Q6VB84 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD4L3Q6VB84 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD4L3Q6VB84 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD4L3Q6VB84 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD4L3Q6VB84 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD4L3Q6VB84 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD4L3Q6VB84 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms