Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SAMD1Q6SPF0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SAMD1Q6SPF0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SAMD1Q6SPF0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SAMD1Q6SPF0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SAMD1Q6SPF0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SAMD1Q6SPF0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SAMD1Q6SPF0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SAMD1Q6SPF0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SAMD1Q6SPF0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SAMD1Q6SPF0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD1Q6SPF0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD1Q6SPF0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SAMD1Q6SPF0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SAMD1Q6SPF0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SAMD1Q6SPF0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SAMD1Q6SPF0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SAMD1Q6SPF0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SAMD1Q6SPF0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SAMD1Q6SPF0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SAMD1Q6SPF0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SAMD1Q6SPF0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SAMD1Q6SPF0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SAMD1Q6SPF0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SAMD1Q6SPF0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SAMD1Q6SPF0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SAMD1Q6SPF0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SAMD1Q6SPF0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SAMD1Q6SPF0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SAMD1Q6SPF0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SAMD1Q6SPF0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SAMD1Q6SPF0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SAMD1Q6SPF0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms