Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOA5Q6Q788 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOA5Q6Q788 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOA5Q6Q788 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
APOA5Q6Q788 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
APOA5Q6Q788 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
APOA5Q6Q788 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
APOA5Q6Q788 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
APOA5Q6Q788 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
APOA5Q6Q788 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
APOA5Q6Q788 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
APOA5Q6Q788 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
APOA5Q6Q788 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
APOA5Q6Q788 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
APOA5Q6Q788 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
APOA5Q6Q788 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
APOA5Q6Q788 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
APOA5Q6Q788 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APOA5Q6Q788 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
APOA5Q6Q788 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
APOA5Q6Q788 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
APOA5Q6Q788 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
APOA5Q6Q788 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
APOA5Q6Q788 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APOA5Q6Q788 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APOA5Q6Q788 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APOA5Q6Q788 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
APOA5Q6Q788 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APOA5Q6Q788 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
APOA5Q6Q788 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
APOA5Q6Q788 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APOA5Q6Q788 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APOA5Q6Q788 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APOA5Q6Q788 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APOA5Q6Q788 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APOA5Q6Q788 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
APOA5Q6Q788 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APOA5Q6Q788 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
APOA5Q6Q788 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
APOA5Q6Q788 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
APOA5Q6Q788 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
APOA5Q6Q788 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
APOA5Q6Q788 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APOA5Q6Q788 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
APOA5Q6Q788 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
APOA5Q6Q788 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
APOA5Q6Q788 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
APOA5Q6Q788 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
APOA5Q6Q788 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
APOA5Q6Q788 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
APOA5Q6Q788 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
APOA5Q6Q788 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
APOA5Q6Q788 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
APOA5Q6Q788 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
APOA5Q6Q788 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
APOA5Q6Q788 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
APOA5Q6Q788 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
APOA5Q6Q788 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
APOA5Q6Q788 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
APOA5Q6Q788 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
APOA5Q6Q788 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
APOA5Q6Q788 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
APOA5Q6Q788 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
APOA5Q6Q788 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
APOA5Q6Q788 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
APOA5Q6Q788 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
APOA5Q6Q788 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms