Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CRIP3Q6Q6R5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms