Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC137Q6PK04 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC137Q6PK04 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC137Q6PK04 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC137Q6PK04 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms