Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PdgfrlQ6PE55 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PdgfrlQ6PE55 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PdgfrlQ6PE55 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PdgfrlQ6PE55 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PdgfrlQ6PE55 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PdgfrlQ6PE55 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PdgfrlQ6PE55 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PdgfrlQ6PE55 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PdgfrlQ6PE55 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PdgfrlQ6PE55 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PdgfrlQ6PE55 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PdgfrlQ6PE55 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PdgfrlQ6PE55 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PdgfrlQ6PE55 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PdgfrlQ6PE55 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PdgfrlQ6PE55 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfrlQ6PE55 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfrlQ6PE55 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfrlQ6PE55 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfrlQ6PE55 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfrlQ6PE55 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdgfrlQ6PE55 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PdgfrlQ6PE55 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PdgfrlQ6PE55 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PdgfrlQ6PE55 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdgfrlQ6PE55 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdgfrlQ6PE55 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdgfrlQ6PE55 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfrlQ6PE55 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfrlQ6PE55 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfrlQ6PE55 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfrlQ6PE55 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfrlQ6PE55 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PdgfrlQ6PE55 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PdgfrlQ6PE55 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 478.9 ms