Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE54

Dhx40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx40Q6PE54 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Dhx40Q6PE54 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Dhx40Q6PE54 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Dhx40Q6PE54 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Dhx40Q6PE54 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dhx40Q6PE54 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dhx40Q6PE54 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dhx40Q6PE54 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dhx40Q6PE54 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dhx40Q6PE54 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dhx40Q6PE54 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dhx40Q6PE54 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dhx40Q6PE54 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dhx40Q6PE54 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Dhx40Q6PE54 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dhx40Q6PE54 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dhx40Q6PE54 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dhx40Q6PE54 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dhx40Q6PE54 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dhx40Q6PE54 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dhx40Q6PE54 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dhx40Q6PE54 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Dhx40Q6PE54 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dhx40Q6PE54 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dhx40Q6PE54 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dhx40Q6PE54 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dhx40Q6PE54 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dhx40Q6PE54 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dhx40Q6PE54 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dhx40Q6PE54 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dhx40Q6PE54 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dhx40Q6PE54 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dhx40Q6PE54 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dhx40Q6PE54 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dhx40Q6PE54 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dhx40Q6PE54 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dhx40Q6PE54 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dhx40Q6PE54 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Dhx40Q6PE54 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dhx40Q6PE54 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dhx40Q6PE54 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dhx40Q6PE54 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Dhx40Q6PE54 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dhx40Q6PE54 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dhx40Q6PE54 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dhx40Q6PE54 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dhx40Q6PE54 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dhx40Q6PE54 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dhx40Q6PE54 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dhx40Q6PE54 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Dhx40Q6PE54 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dhx40Q6PE54 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dhx40Q6PE54 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dhx40Q6PE54 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dhx40Q6PE54 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dhx40Q6PE54 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dhx40Q6PE54 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dhx40Q6PE54 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dhx40Q6PE54 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dhx40Q6PE54 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dhx40Q6PE54 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dhx40Q6PE54 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dhx40Q6PE54 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dhx40Q6PE54 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dhx40Q6PE54 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dhx40Q6PE54 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dhx40Q6PE54 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dhx40Q6PE54 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dhx40Q6PE54 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dhx40Q6PE54 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dhx40Q6PE54 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dhx40Q6PE54 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dhx40Q6PE54 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dhx40Q6PE54 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dhx40Q6PE54 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dhx40Q6PE54 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dhx40Q6PE54 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dhx40Q6PE54 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dhx40Q6PE54 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dhx40Q6PE54 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dhx40Q6PE54 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dhx40Q6PE54 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dhx40Q6PE54 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dhx40Q6PE54 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dhx40Q6PE54 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dhx40Q6PE54 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dhx40Q6PE54 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dhx40Q6PE54 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dhx40Q6PE54 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dhx40Q6PE54 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dhx40Q6PE54 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dhx40Q6PE54 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dhx40Q6PE54 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dhx40Q6PE54 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dhx40Q6PE54 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dhx40Q6PE54 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dhx40Q6PE54 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dhx40Q6PE54 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199.3 ms