Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Chd4Q6PDQ2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Chd4Q6PDQ2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Chd4Q6PDQ2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Chd4Q6PDQ2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Chd4Q6PDQ2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Chd4Q6PDQ2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Chd4Q6PDQ2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Chd4Q6PDQ2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Chd4Q6PDQ2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Chd4Q6PDQ2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Chd4Q6PDQ2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Chd4Q6PDQ2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Chd4Q6PDQ2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Chd4Q6PDQ2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Chd4Q6PDQ2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Chd4Q6PDQ2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Chd4Q6PDQ2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Chd4Q6PDQ2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Chd4Q6PDQ2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Chd4Q6PDQ2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Chd4Q6PDQ2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Chd4Q6PDQ2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Chd4Q6PDQ2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Chd4Q6PDQ2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Chd4Q6PDQ2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Chd4Q6PDQ2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Chd4Q6PDQ2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Chd4Q6PDQ2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Chd4Q6PDQ2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Chd4Q6PDQ2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Chd4Q6PDQ2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Chd4Q6PDQ2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Chd4Q6PDQ2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Chd4Q6PDQ2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Chd4Q6PDQ2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Chd4Q6PDQ2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Chd4Q6PDQ2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Chd4Q6PDQ2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Chd4Q6PDQ2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Chd4Q6PDQ2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Chd4Q6PDQ2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Chd4Q6PDQ2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Chd4Q6PDQ2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Chd4Q6PDQ2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Chd4Q6PDQ2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Chd4Q6PDQ2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Chd4Q6PDQ2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Chd4Q6PDQ2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Chd4Q6PDQ2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Chd4Q6PDQ2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Chd4Q6PDQ2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Chd4Q6PDQ2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Chd4Q6PDQ2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Chd4Q6PDQ2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Chd4Q6PDQ2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Chd4Q6PDQ2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Chd4Q6PDQ2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Chd4Q6PDQ2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Chd4Q6PDQ2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Chd4Q6PDQ2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Chd4Q6PDQ2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Chd4Q6PDQ2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Chd4Q6PDQ2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Chd4Q6PDQ2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Chd4Q6PDQ2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Chd4Q6PDQ2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Chd4Q6PDQ2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
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