Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rundc3bQ6PDC0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rundc3bQ6PDC0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms