Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD74

AAGAB, Alpha- and gamma-adaptin-binding protein p34, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AAGABQ6PD74 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AAGABQ6PD74 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AAGABQ6PD74 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AAGABQ6PD74 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms