Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zbtb40Q6PCS8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zbtb40Q6PCS8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zbtb40Q6PCS8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zbtb40Q6PCS8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Zbtb40Q6PCS8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zbtb40Q6PCS8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zbtb40Q6PCS8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zbtb40Q6PCS8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zbtb40Q6PCS8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zbtb40Q6PCS8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zbtb40Q6PCS8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zbtb40Q6PCS8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Zbtb40Q6PCS8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zbtb40Q6PCS8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zbtb40Q6PCS8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zbtb40Q6PCS8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zbtb40Q6PCS8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zbtb40Q6PCS8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zbtb40Q6PCS8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zbtb40Q6PCS8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zbtb40Q6PCS8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zbtb40Q6PCS8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zbtb40Q6PCS8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zbtb40Q6PCS8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zbtb40Q6PCS8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zbtb40Q6PCS8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zbtb40Q6PCS8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Zbtb40Q6PCS8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zbtb40Q6PCS8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zbtb40Q6PCS8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zbtb40Q6PCS8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zbtb40Q6PCS8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zbtb40Q6PCS8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zbtb40Q6PCS8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zbtb40Q6PCS8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zbtb40Q6PCS8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zbtb40Q6PCS8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zbtb40Q6PCS8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zbtb40Q6PCS8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zbtb40Q6PCS8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zbtb40Q6PCS8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zbtb40Q6PCS8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zbtb40Q6PCS8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zbtb40Q6PCS8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zbtb40Q6PCS8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zbtb40Q6PCS8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Zbtb40Q6PCS8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zbtb40Q6PCS8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zbtb40Q6PCS8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zbtb40Q6PCS8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zbtb40Q6PCS8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zbtb40Q6PCS8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zbtb40Q6PCS8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zbtb40Q6PCS8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zbtb40Q6PCS8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zbtb40Q6PCS8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zbtb40Q6PCS8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zbtb40Q6PCS8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zbtb40Q6PCS8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zbtb40Q6PCS8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms