Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ttbk1Q6PCN3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ttbk1Q6PCN3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ttbk1Q6PCN3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ttbk1Q6PCN3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ttbk1Q6PCN3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Ttbk1Q6PCN3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ttbk1Q6PCN3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ttbk1Q6PCN3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Ttbk1Q6PCN3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Ttbk1Q6PCN3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ttbk1Q6PCN3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ttbk1Q6PCN3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ttbk1Q6PCN3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ttbk1Q6PCN3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ttbk1Q6PCN3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ttbk1Q6PCN3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ttbk1Q6PCN3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ttbk1Q6PCN3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ttbk1Q6PCN3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ttbk1Q6PCN3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ttbk1Q6PCN3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ttbk1Q6PCN3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ttbk1Q6PCN3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ttbk1Q6PCN3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ttbk1Q6PCN3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ttbk1Q6PCN3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Ttbk1Q6PCN3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Ttbk1Q6PCN3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ttbk1Q6PCN3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ttbk1Q6PCN3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ttbk1Q6PCN3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ttbk1Q6PCN3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ttbk1Q6PCN3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ttbk1Q6PCN3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ttbk1Q6PCN3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ttbk1Q6PCN3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ttbk1Q6PCN3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ttbk1Q6PCN3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ttbk1Q6PCN3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ttbk1Q6PCN3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ttbk1Q6PCN3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Ttbk1Q6PCN3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Ttbk1Q6PCN3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ttbk1Q6PCN3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ttbk1Q6PCN3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ttbk1Q6PCN3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ttbk1Q6PCN3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ttbk1Q6PCN3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ttbk1Q6PCN3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ttbk1Q6PCN3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ttbk1Q6PCN3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ttbk1Q6PCN3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ttbk1Q6PCN3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ttbk1Q6PCN3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ttbk1Q6PCN3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Ttbk1Q6PCN3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ttbk1Q6PCN3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ttbk1Q6PCN3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ttbk1Q6PCN3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Ttbk1Q6PCN3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ttbk1Q6PCN3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ttbk1Q6PCN3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ttbk1Q6PCN3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ttbk1Q6PCN3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ttbk1Q6PCN3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ttbk1Q6PCN3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ttbk1Q6PCN3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ttbk1Q6PCN3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ttbk1Q6PCN3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ttbk1Q6PCN3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ttbk1Q6PCN3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Ttbk1Q6PCN3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ttbk1Q6PCN3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ttbk1Q6PCN3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ttbk1Q6PCN3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ttbk1Q6PCN3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ttbk1Q6PCN3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ttbk1Q6PCN3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Ttbk1Q6PCN3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ttbk1Q6PCN3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ttbk1Q6PCN3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ttbk1Q6PCN3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ttbk1Q6PCN3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Ttbk1Q6PCN3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ttbk1Q6PCN3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ttbk1Q6PCN3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ttbk1Q6PCN3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ttbk1Q6PCN3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ttbk1Q6PCN3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ttbk1Q6PCN3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ttbk1Q6PCN3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ttbk1Q6PCN3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ttbk1Q6PCN3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ttbk1Q6PCN3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ttbk1Q6PCN3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ttbk1Q6PCN3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ttbk1Q6PCN3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ttbk1Q6PCN3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Ttbk1Q6PCN3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms