Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LMOD2Q6P5Q4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LMOD2Q6P5Q4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LMOD2Q6P5Q4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LMOD2Q6P5Q4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LMOD2Q6P5Q4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
LMOD2Q6P5Q4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.82■■■■□ 3
LMOD2Q6P5Q4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
LMOD2Q6P5Q4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
LMOD2Q6P5Q4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.81■■■■□ 3
LMOD2Q6P5Q4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
LMOD2Q6P5Q4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
LMOD2Q6P5Q4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
LMOD2Q6P5Q4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.8■■■■□ 3
LMOD2Q6P5Q4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
LMOD2Q6P5Q4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
LMOD2Q6P5Q4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
LMOD2Q6P5Q4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LMOD2Q6P5Q4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
LMOD2Q6P5Q4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LMOD2Q6P5Q4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
LMOD2Q6P5Q4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
LMOD2Q6P5Q4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
LMOD2Q6P5Q4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
LMOD2Q6P5Q4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LMOD2Q6P5Q4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
LMOD2Q6P5Q4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
LMOD2Q6P5Q4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LMOD2Q6P5Q4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
LMOD2Q6P5Q4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
LMOD2Q6P5Q4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LMOD2Q6P5Q4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
LMOD2Q6P5Q4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
LMOD2Q6P5Q4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
LMOD2Q6P5Q4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LMOD2Q6P5Q4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LMOD2Q6P5Q4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LMOD2Q6P5Q4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LMOD2Q6P5Q4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LMOD2Q6P5Q4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LMOD2Q6P5Q4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LMOD2Q6P5Q4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LMOD2Q6P5Q4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LMOD2Q6P5Q4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
LMOD2Q6P5Q4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LMOD2Q6P5Q4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LMOD2Q6P5Q4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LMOD2Q6P5Q4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LMOD2Q6P5Q4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LMOD2Q6P5Q4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LMOD2Q6P5Q4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LMOD2Q6P5Q4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
LMOD2Q6P5Q4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LMOD2Q6P5Q4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LMOD2Q6P5Q4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LMOD2Q6P5Q4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LMOD2Q6P5Q4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LMOD2Q6P5Q4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LMOD2Q6P5Q4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
LMOD2Q6P5Q4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LMOD2Q6P5Q4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
LMOD2Q6P5Q4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
LMOD2Q6P5Q4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LMOD2Q6P5Q4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LMOD2Q6P5Q4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
LMOD2Q6P5Q4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
LMOD2Q6P5Q4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
LMOD2Q6P5Q4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LMOD2Q6P5Q4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LMOD2Q6P5Q4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
LMOD2Q6P5Q4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
LMOD2Q6P5Q4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LMOD2Q6P5Q4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
LMOD2Q6P5Q4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LMOD2Q6P5Q4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LMOD2Q6P5Q4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LMOD2Q6P5Q4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
LMOD2Q6P5Q4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LMOD2Q6P5Q4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LMOD2Q6P5Q4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LMOD2Q6P5Q4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LMOD2Q6P5Q4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LMOD2Q6P5Q4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LMOD2Q6P5Q4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
LMOD2Q6P5Q4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LMOD2Q6P5Q4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LMOD2Q6P5Q4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LMOD2Q6P5Q4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LMOD2Q6P5Q4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LMOD2Q6P5Q4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LMOD2Q6P5Q4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LMOD2Q6P5Q4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
LMOD2Q6P5Q4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
LMOD2Q6P5Q4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LMOD2Q6P5Q4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LMOD2Q6P5Q4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
LMOD2Q6P5Q4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LMOD2Q6P5Q4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LMOD2Q6P5Q4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.97
LMOD2Q6P5Q4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms