Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T1

Snx19, Sorting nexin-19, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx19Q6P4T1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx19Q6P4T1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx19Q6P4T1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx19Q6P4T1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx19Q6P4T1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx19Q6P4T1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx19Q6P4T1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx19Q6P4T1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx19Q6P4T1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx19Q6P4T1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx19Q6P4T1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx19Q6P4T1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx19Q6P4T1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx19Q6P4T1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx19Q6P4T1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx19Q6P4T1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx19Q6P4T1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx19Q6P4T1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx19Q6P4T1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx19Q6P4T1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx19Q6P4T1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx19Q6P4T1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx19Q6P4T1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx19Q6P4T1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx19Q6P4T1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx19Q6P4T1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx19Q6P4T1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx19Q6P4T1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx19Q6P4T1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx19Q6P4T1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx19Q6P4T1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx19Q6P4T1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx19Q6P4T1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx19Q6P4T1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx19Q6P4T1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx19Q6P4T1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx19Q6P4T1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx19Q6P4T1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx19Q6P4T1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx19Q6P4T1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx19Q6P4T1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx19Q6P4T1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx19Q6P4T1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx19Q6P4T1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx19Q6P4T1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx19Q6P4T1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx19Q6P4T1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx19Q6P4T1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx19Q6P4T1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx19Q6P4T1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx19Q6P4T1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx19Q6P4T1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx19Q6P4T1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx19Q6P4T1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx19Q6P4T1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx19Q6P4T1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx19Q6P4T1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx19Q6P4T1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx19Q6P4T1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx19Q6P4T1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx19Q6P4T1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx19Q6P4T1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx19Q6P4T1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx19Q6P4T1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx19Q6P4T1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx19Q6P4T1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx19Q6P4T1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx19Q6P4T1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx19Q6P4T1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx19Q6P4T1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx19Q6P4T1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms