Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2H8

TMEM53, Transmembrane protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM53Q6P2H8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM53Q6P2H8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM53Q6P2H8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM53Q6P2H8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM53Q6P2H8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM53Q6P2H8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM53Q6P2H8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM53Q6P2H8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM53Q6P2H8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM53Q6P2H8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM53Q6P2H8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM53Q6P2H8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM53Q6P2H8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM53Q6P2H8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM53Q6P2H8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM53Q6P2H8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM53Q6P2H8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM53Q6P2H8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM53Q6P2H8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM53Q6P2H8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM53Q6P2H8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM53Q6P2H8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM53Q6P2H8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM53Q6P2H8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM53Q6P2H8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM53Q6P2H8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1718.1 ms