Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1S2

C3orf33, Protein C3orf33, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf33Q6P1S2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C3orf33Q6P1S2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms