Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC27A4Q6P1M0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A4Q6P1M0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A4Q6P1M0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms