Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1F6

Ppp2r2a, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r2aQ6P1F6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp2r2aQ6P1F6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp2r2aQ6P1F6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp2r2aQ6P1F6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp2r2aQ6P1F6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp2r2aQ6P1F6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp2r2aQ6P1F6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp2r2aQ6P1F6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp2r2aQ6P1F6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp2r2aQ6P1F6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp2r2aQ6P1F6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp2r2aQ6P1F6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp2r2aQ6P1F6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp2r2aQ6P1F6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp2r2aQ6P1F6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp2r2aQ6P1F6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp2r2aQ6P1F6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp2r2aQ6P1F6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp2r2aQ6P1F6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp2r2aQ6P1F6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp2r2aQ6P1F6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp2r2aQ6P1F6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp2r2aQ6P1F6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp2r2aQ6P1F6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp2r2aQ6P1F6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp2r2aQ6P1F6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp2r2aQ6P1F6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp2r2aQ6P1F6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp2r2aQ6P1F6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp2r2aQ6P1F6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp2r2aQ6P1F6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp2r2aQ6P1F6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp2r2aQ6P1F6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp2r2aQ6P1F6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp2r2aQ6P1F6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp2r2aQ6P1F6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp2r2aQ6P1F6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp2r2aQ6P1F6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp2r2aQ6P1F6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp2r2aQ6P1F6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp2r2aQ6P1F6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp2r2aQ6P1F6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp2r2aQ6P1F6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp2r2aQ6P1F6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp2r2aQ6P1F6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp2r2aQ6P1F6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp2r2aQ6P1F6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp2r2aQ6P1F6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp2r2aQ6P1F6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp2r2aQ6P1F6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp2r2aQ6P1F6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp2r2aQ6P1F6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppp2r2aQ6P1F6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppp2r2aQ6P1F6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppp2r2aQ6P1F6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp2r2aQ6P1F6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp2r2aQ6P1F6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp2r2aQ6P1F6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp2r2aQ6P1F6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp2r2aQ6P1F6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp2r2aQ6P1F6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp2r2aQ6P1F6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp2r2aQ6P1F6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp2r2aQ6P1F6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp2r2aQ6P1F6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp2r2aQ6P1F6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms