Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3F3CQ6NXT2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
H3F3CQ6NXT2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3F3CQ6NXT2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms