Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fndc3bQ6NWW9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fndc3bQ6NWW9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fndc3bQ6NWW9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc3bQ6NWW9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc3bQ6NWW9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc3bQ6NWW9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc3bQ6NWW9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc3bQ6NWW9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc3bQ6NWW9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fndc3bQ6NWW9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fndc3bQ6NWW9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fndc3bQ6NWW9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fndc3bQ6NWW9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fndc3bQ6NWW9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fndc3bQ6NWW9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fndc3bQ6NWW9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fndc3bQ6NWW9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fndc3bQ6NWW9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fndc3bQ6NWW9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fndc3bQ6NWW9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fndc3bQ6NWW9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fndc3bQ6NWW9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fndc3bQ6NWW9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc3bQ6NWW9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc3bQ6NWW9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc3bQ6NWW9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc3bQ6NWW9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc3bQ6NWW9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc3bQ6NWW9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc3bQ6NWW9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc3bQ6NWW9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc3bQ6NWW9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc3bQ6NWW9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fndc3bQ6NWW9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fndc3bQ6NWW9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fndc3bQ6NWW9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fndc3bQ6NWW9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fndc3bQ6NWW9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fndc3bQ6NWW9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fndc3bQ6NWW9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fndc3bQ6NWW9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fndc3bQ6NWW9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fndc3bQ6NWW9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fndc3bQ6NWW9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fndc3bQ6NWW9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fndc3bQ6NWW9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fndc3bQ6NWW9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fndc3bQ6NWW9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fndc3bQ6NWW9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc3bQ6NWW9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc3bQ6NWW9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc3bQ6NWW9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fndc3bQ6NWW9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Fndc3bQ6NWW9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fndc3bQ6NWW9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fndc3bQ6NWW9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fndc3bQ6NWW9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fndc3bQ6NWW9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fndc3bQ6NWW9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fndc3bQ6NWW9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fndc3bQ6NWW9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Fndc3bQ6NWW9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fndc3bQ6NWW9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fndc3bQ6NWW9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Fndc3bQ6NWW9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fndc3bQ6NWW9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fndc3bQ6NWW9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fndc3bQ6NWW9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fndc3bQ6NWW9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms