Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SWSAP1Q6NVH7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SWSAP1Q6NVH7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SWSAP1Q6NVH7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SWSAP1Q6NVH7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SWSAP1Q6NVH7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SWSAP1Q6NVH7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SWSAP1Q6NVH7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SWSAP1Q6NVH7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SWSAP1Q6NVH7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SWSAP1Q6NVH7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SWSAP1Q6NVH7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SWSAP1Q6NVH7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SWSAP1Q6NVH7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SWSAP1Q6NVH7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SWSAP1Q6NVH7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SWSAP1Q6NVH7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SWSAP1Q6NVH7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SWSAP1Q6NVH7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SWSAP1Q6NVH7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SWSAP1Q6NVH7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SWSAP1Q6NVH7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SWSAP1Q6NVH7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SWSAP1Q6NVH7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SWSAP1Q6NVH7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SWSAP1Q6NVH7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SWSAP1Q6NVH7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SWSAP1Q6NVH7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SWSAP1Q6NVH7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SWSAP1Q6NVH7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SWSAP1Q6NVH7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SWSAP1Q6NVH7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SWSAP1Q6NVH7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SWSAP1Q6NVH7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SWSAP1Q6NVH7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SWSAP1Q6NVH7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SWSAP1Q6NVH7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SWSAP1Q6NVH7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SWSAP1Q6NVH7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SWSAP1Q6NVH7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SWSAP1Q6NVH7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms