Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpsf6Q6NVF9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpsf6Q6NVF9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpsf6Q6NVF9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms