Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP4R4Q6NUP7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP4R4Q6NUP7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP4R4Q6NUP7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms