Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
APOBEC3HQ6NTF7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
APOBEC3HQ6NTF7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms