Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8S8

B4galnt3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4galnt3Q6L8S8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
B4galnt3Q6L8S8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
B4galnt3Q6L8S8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
B4galnt3Q6L8S8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
B4galnt3Q6L8S8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
B4galnt3Q6L8S8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
B4galnt3Q6L8S8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
B4galnt3Q6L8S8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
B4galnt3Q6L8S8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
B4galnt3Q6L8S8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
B4galnt3Q6L8S8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
B4galnt3Q6L8S8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
B4galnt3Q6L8S8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
B4galnt3Q6L8S8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
B4galnt3Q6L8S8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
B4galnt3Q6L8S8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
B4galnt3Q6L8S8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
B4galnt3Q6L8S8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
B4galnt3Q6L8S8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
B4galnt3Q6L8S8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
B4galnt3Q6L8S8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
B4galnt3Q6L8S8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
B4galnt3Q6L8S8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
B4galnt3Q6L8S8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
B4galnt3Q6L8S8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
B4galnt3Q6L8S8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
B4galnt3Q6L8S8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
B4galnt3Q6L8S8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
B4galnt3Q6L8S8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
B4galnt3Q6L8S8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
B4galnt3Q6L8S8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
B4galnt3Q6L8S8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
B4galnt3Q6L8S8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
B4galnt3Q6L8S8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
B4galnt3Q6L8S8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
B4galnt3Q6L8S8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
B4galnt3Q6L8S8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
B4galnt3Q6L8S8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
B4galnt3Q6L8S8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
B4galnt3Q6L8S8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
B4galnt3Q6L8S8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
B4galnt3Q6L8S8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
B4galnt3Q6L8S8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
B4galnt3Q6L8S8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
B4galnt3Q6L8S8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
B4galnt3Q6L8S8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
B4galnt3Q6L8S8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
B4galnt3Q6L8S8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
B4galnt3Q6L8S8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
B4galnt3Q6L8S8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
B4galnt3Q6L8S8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
B4galnt3Q6L8S8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
B4galnt3Q6L8S8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
B4galnt3Q6L8S8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
B4galnt3Q6L8S8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
B4galnt3Q6L8S8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
B4galnt3Q6L8S8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
B4galnt3Q6L8S8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
B4galnt3Q6L8S8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
B4galnt3Q6L8S8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
B4galnt3Q6L8S8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
B4galnt3Q6L8S8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
B4galnt3Q6L8S8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
B4galnt3Q6L8S8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
B4galnt3Q6L8S8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
B4galnt3Q6L8S8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
B4galnt3Q6L8S8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
B4galnt3Q6L8S8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
B4galnt3Q6L8S8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
B4galnt3Q6L8S8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
B4galnt3Q6L8S8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms