Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDE12Q6L8Q7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE12Q6L8Q7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE12Q6L8Q7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE12Q6L8Q7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE12Q6L8Q7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE12Q6L8Q7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE12Q6L8Q7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE12Q6L8Q7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE12Q6L8Q7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE12Q6L8Q7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE12Q6L8Q7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE12Q6L8Q7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE12Q6L8Q7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE12Q6L8Q7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE12Q6L8Q7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE12Q6L8Q7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE12Q6L8Q7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE12Q6L8Q7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE12Q6L8Q7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE12Q6L8Q7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE12Q6L8Q7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE12Q6L8Q7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE12Q6L8Q7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE12Q6L8Q7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE12Q6L8Q7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE12Q6L8Q7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE12Q6L8Q7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE12Q6L8Q7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE12Q6L8Q7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PDE12Q6L8Q7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE12Q6L8Q7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE12Q6L8Q7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE12Q6L8Q7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE12Q6L8Q7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms