Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NIPBLQ6KC79 CIRBP-227ENST00000590188 361 ntTSL 315.41■□□□□ 0.062e-6■■■■□ 25.1
NIPBLQ6KC79 CIRBP-206ENST00000585914 1052 ntTSL 515.39■□□□□ 0.052e-6■■■■□ 25.1
NIPBLQ6KC79 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.042e-6■■■■□ 25.1
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NIPBLQ6KC79 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.612e-6■■■■□ 25.1
NIPBLQ6KC79 CDK1-207ENST00000519078 723 ntTSL 34.76□□□□□ -1.652e-6■■■■□ 25.1
NIPBLQ6KC79 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.732e-6■■■■□ 25.1
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NIPBLQ6KC79 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.912e-7■■■■□ 25.1
NIPBLQ6KC79 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.982e-6■■■■□ 25.1
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NIPBLQ6KC79 FCGR2C-209ENST00000507374 553 ntTSL 42.44□□□□□ -2.022e-6■■■■□ 25.1
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