Protein–RNA interactions for Protein: Q6IR42

Zcwpw1, Zinc finger CW-type PWWP domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcwpw1Q6IR42 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zcwpw1Q6IR42 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zcwpw1Q6IR42 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Zcwpw1Q6IR42 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zcwpw1Q6IR42 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zcwpw1Q6IR42 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Zcwpw1Q6IR42 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zcwpw1Q6IR42 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zcwpw1Q6IR42 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zcwpw1Q6IR42 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zcwpw1Q6IR42 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zcwpw1Q6IR42 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zcwpw1Q6IR42 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zcwpw1Q6IR42 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zcwpw1Q6IR42 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zcwpw1Q6IR42 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Zcwpw1Q6IR42 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zcwpw1Q6IR42 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zcwpw1Q6IR42 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zcwpw1Q6IR42 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zcwpw1Q6IR42 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zcwpw1Q6IR42 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Zcwpw1Q6IR42 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zcwpw1Q6IR42 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zcwpw1Q6IR42 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zcwpw1Q6IR42 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zcwpw1Q6IR42 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zcwpw1Q6IR42 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zcwpw1Q6IR42 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zcwpw1Q6IR42 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zcwpw1Q6IR42 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zcwpw1Q6IR42 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zcwpw1Q6IR42 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zcwpw1Q6IR42 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zcwpw1Q6IR42 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zcwpw1Q6IR42 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zcwpw1Q6IR42 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zcwpw1Q6IR42 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zcwpw1Q6IR42 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zcwpw1Q6IR42 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Zcwpw1Q6IR42 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zcwpw1Q6IR42 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zcwpw1Q6IR42 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zcwpw1Q6IR42 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zcwpw1Q6IR42 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zcwpw1Q6IR42 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zcwpw1Q6IR42 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Zcwpw1Q6IR42 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zcwpw1Q6IR42 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zcwpw1Q6IR42 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zcwpw1Q6IR42 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zcwpw1Q6IR42 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zcwpw1Q6IR42 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zcwpw1Q6IR42 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zcwpw1Q6IR42 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Zcwpw1Q6IR42 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zcwpw1Q6IR42 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Zcwpw1Q6IR42 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zcwpw1Q6IR42 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zcwpw1Q6IR42 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Zcwpw1Q6IR42 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zcwpw1Q6IR42 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zcwpw1Q6IR42 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zcwpw1Q6IR42 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zcwpw1Q6IR42 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zcwpw1Q6IR42 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zcwpw1Q6IR42 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zcwpw1Q6IR42 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zcwpw1Q6IR42 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zcwpw1Q6IR42 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zcwpw1Q6IR42 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms