Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPX1

TBC1D3C, TBC1 domain family member 3C, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D3CQ6IPX1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TBC1D3CQ6IPX1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TBC1D3CQ6IPX1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TBC1D3CQ6IPX1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TBC1D3CQ6IPX1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TBC1D3CQ6IPX1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TBC1D3CQ6IPX1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TBC1D3CQ6IPX1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TBC1D3CQ6IPX1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TBC1D3CQ6IPX1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TBC1D3CQ6IPX1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TBC1D3CQ6IPX1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TBC1D3CQ6IPX1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TBC1D3CQ6IPX1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TBC1D3CQ6IPX1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TBC1D3CQ6IPX1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TBC1D3CQ6IPX1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TBC1D3CQ6IPX1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TBC1D3CQ6IPX1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TBC1D3CQ6IPX1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TBC1D3CQ6IPX1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TBC1D3CQ6IPX1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TBC1D3CQ6IPX1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TBC1D3CQ6IPX1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TBC1D3CQ6IPX1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TBC1D3CQ6IPX1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TBC1D3CQ6IPX1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TBC1D3CQ6IPX1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TBC1D3CQ6IPX1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TBC1D3CQ6IPX1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TBC1D3CQ6IPX1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TBC1D3CQ6IPX1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TBC1D3CQ6IPX1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TBC1D3CQ6IPX1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TBC1D3CQ6IPX1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TBC1D3CQ6IPX1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TBC1D3CQ6IPX1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TBC1D3CQ6IPX1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TBC1D3CQ6IPX1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBC1D3CQ6IPX1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBC1D3CQ6IPX1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBC1D3CQ6IPX1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TBC1D3CQ6IPX1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TBC1D3CQ6IPX1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TBC1D3CQ6IPX1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TBC1D3CQ6IPX1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TBC1D3CQ6IPX1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TBC1D3CQ6IPX1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TBC1D3CQ6IPX1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TBC1D3CQ6IPX1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TBC1D3CQ6IPX1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBC1D3CQ6IPX1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBC1D3CQ6IPX1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBC1D3CQ6IPX1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBC1D3CQ6IPX1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBC1D3CQ6IPX1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBC1D3CQ6IPX1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBC1D3CQ6IPX1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBC1D3CQ6IPX1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBC1D3CQ6IPX1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBC1D3CQ6IPX1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBC1D3CQ6IPX1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBC1D3CQ6IPX1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBC1D3CQ6IPX1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TBC1D3CQ6IPX1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TBC1D3CQ6IPX1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TBC1D3CQ6IPX1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TBC1D3CQ6IPX1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms