Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TYW3Q6IPR3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TYW3Q6IPR3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TYW3Q6IPR3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYW3Q6IPR3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYW3Q6IPR3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYW3Q6IPR3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TYW3Q6IPR3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms