Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
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Ddx11Q6AXC6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
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Ddx11Q6AXC6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
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Ddx11Q6AXC6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
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Ddx11Q6AXC6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ddx11Q6AXC6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ddx11Q6AXC6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ddx11Q6AXC6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ddx11Q6AXC6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ddx11Q6AXC6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ddx11Q6AXC6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms