Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atg9aQ68FE2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atg9aQ68FE2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atg9aQ68FE2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atg9aQ68FE2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atg9aQ68FE2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atg9aQ68FE2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atg9aQ68FE2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atg9aQ68FE2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atg9aQ68FE2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atg9aQ68FE2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atg9aQ68FE2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atg9aQ68FE2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atg9aQ68FE2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atg9aQ68FE2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atg9aQ68FE2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atg9aQ68FE2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atg9aQ68FE2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atg9aQ68FE2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atg9aQ68FE2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atg9aQ68FE2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atg9aQ68FE2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atg9aQ68FE2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Atg9aQ68FE2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atg9aQ68FE2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atg9aQ68FE2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Atg9aQ68FE2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Atg9aQ68FE2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atg9aQ68FE2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atg9aQ68FE2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atg9aQ68FE2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atg9aQ68FE2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atg9aQ68FE2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atg9aQ68FE2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atg9aQ68FE2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atg9aQ68FE2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atg9aQ68FE2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atg9aQ68FE2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atg9aQ68FE2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atg9aQ68FE2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atg9aQ68FE2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atg9aQ68FE2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atg9aQ68FE2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atg9aQ68FE2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atg9aQ68FE2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Atg9aQ68FE2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atg9aQ68FE2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atg9aQ68FE2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atg9aQ68FE2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atg9aQ68FE2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atg9aQ68FE2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atg9aQ68FE2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atg9aQ68FE2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atg9aQ68FE2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atg9aQ68FE2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atg9aQ68FE2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atg9aQ68FE2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atg9aQ68FE2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atg9aQ68FE2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atg9aQ68FE2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atg9aQ68FE2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atg9aQ68FE2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atg9aQ68FE2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atg9aQ68FE2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atg9aQ68FE2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atg9aQ68FE2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atg9aQ68FE2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atg9aQ68FE2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atg9aQ68FE2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atg9aQ68FE2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atg9aQ68FE2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atg9aQ68FE2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atg9aQ68FE2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Atg9aQ68FE2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atg9aQ68FE2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atg9aQ68FE2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atg9aQ68FE2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atg9aQ68FE2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atg9aQ68FE2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Atg9aQ68FE2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atg9aQ68FE2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atg9aQ68FE2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atg9aQ68FE2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atg9aQ68FE2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atg9aQ68FE2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atg9aQ68FE2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atg9aQ68FE2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atg9aQ68FE2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atg9aQ68FE2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atg9aQ68FE2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atg9aQ68FE2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atg9aQ68FE2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atg9aQ68FE2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atg9aQ68FE2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atg9aQ68FE2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atg9aQ68FE2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atg9aQ68FE2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atg9aQ68FE2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atg9aQ68FE2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atg9aQ68FE2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms