Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF8

Rapgefl1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgefl1Q68EF8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rapgefl1Q68EF8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rapgefl1Q68EF8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rapgefl1Q68EF8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rapgefl1Q68EF8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rapgefl1Q68EF8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rapgefl1Q68EF8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rapgefl1Q68EF8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rapgefl1Q68EF8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rapgefl1Q68EF8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Rapgefl1Q68EF8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Rapgefl1Q68EF8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rapgefl1Q68EF8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rapgefl1Q68EF8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rapgefl1Q68EF8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rapgefl1Q68EF8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgefl1Q68EF8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgefl1Q68EF8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgefl1Q68EF8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgefl1Q68EF8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgefl1Q68EF8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgefl1Q68EF8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgefl1Q68EF8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgefl1Q68EF8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgefl1Q68EF8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgefl1Q68EF8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rapgefl1Q68EF8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rapgefl1Q68EF8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rapgefl1Q68EF8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rapgefl1Q68EF8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rapgefl1Q68EF8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rapgefl1Q68EF8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rapgefl1Q68EF8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rapgefl1Q68EF8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rapgefl1Q68EF8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rapgefl1Q68EF8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rapgefl1Q68EF8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Rapgefl1Q68EF8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rapgefl1Q68EF8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rapgefl1Q68EF8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rapgefl1Q68EF8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rapgefl1Q68EF8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rapgefl1Q68EF8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rapgefl1Q68EF8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rapgefl1Q68EF8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rapgefl1Q68EF8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rapgefl1Q68EF8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rapgefl1Q68EF8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rapgefl1Q68EF8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rapgefl1Q68EF8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rapgefl1Q68EF8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rapgefl1Q68EF8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rapgefl1Q68EF8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rapgefl1Q68EF8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rapgefl1Q68EF8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rapgefl1Q68EF8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rapgefl1Q68EF8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rapgefl1Q68EF8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rapgefl1Q68EF8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rapgefl1Q68EF8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rapgefl1Q68EF8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rapgefl1Q68EF8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rapgefl1Q68EF8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rapgefl1Q68EF8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rapgefl1Q68EF8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rapgefl1Q68EF8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rapgefl1Q68EF8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rapgefl1Q68EF8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rapgefl1Q68EF8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rapgefl1Q68EF8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rapgefl1Q68EF8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rapgefl1Q68EF8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rapgefl1Q68EF8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms