Protein–RNA interactions for Protein: Q64691

Capn3, Calpain-3, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn3Q64691 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn3Q64691 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn3Q64691 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Capn3Q64691 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn3Q64691 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn3Q64691 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capn3Q64691 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Capn3Q64691 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capn3Q64691 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capn3Q64691 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn3Q64691 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn3Q64691 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn3Q64691 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn3Q64691 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn3Q64691 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn3Q64691 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn3Q64691 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn3Q64691 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn3Q64691 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn3Q64691 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn3Q64691 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn3Q64691 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn3Q64691 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn3Q64691 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn3Q64691 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn3Q64691 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn3Q64691 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn3Q64691 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn3Q64691 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn3Q64691 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn3Q64691 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn3Q64691 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn3Q64691 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn3Q64691 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn3Q64691 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn3Q64691 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms