Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Abcd2Q61285 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcd2Q61285 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcd2Q61285 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206.7 ms