Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpc6Q61143 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpc6Q61143 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpc6Q61143 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpc6Q61143 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpc6Q61143 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpc6Q61143 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpc6Q61143 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpc6Q61143 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpc6Q61143 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpc6Q61143 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpc6Q61143 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc6Q61143 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc6Q61143 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc6Q61143 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc6Q61143 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc6Q61143 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc6Q61143 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc6Q61143 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpc6Q61143 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpc6Q61143 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpc6Q61143 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpc6Q61143 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpc6Q61143 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpc6Q61143 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpc6Q61143 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpc6Q61143 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpc6Q61143 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpc6Q61143 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms