Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prpf4bQ61136 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prpf4bQ61136 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prpf4bQ61136 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prpf4bQ61136 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prpf4bQ61136 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prpf4bQ61136 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prpf4bQ61136 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prpf4bQ61136 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prpf4bQ61136 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prpf4bQ61136 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prpf4bQ61136 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prpf4bQ61136 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prpf4bQ61136 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prpf4bQ61136 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prpf4bQ61136 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prpf4bQ61136 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prpf4bQ61136 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prpf4bQ61136 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prpf4bQ61136 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prpf4bQ61136 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prpf4bQ61136 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prpf4bQ61136 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prpf4bQ61136 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prpf4bQ61136 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Prpf4bQ61136 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prpf4bQ61136 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prpf4bQ61136 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prpf4bQ61136 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prpf4bQ61136 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prpf4bQ61136 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prpf4bQ61136 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prpf4bQ61136 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prpf4bQ61136 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prpf4bQ61136 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prpf4bQ61136 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prpf4bQ61136 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prpf4bQ61136 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prpf4bQ61136 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prpf4bQ61136 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Prpf4bQ61136 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prpf4bQ61136 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prpf4bQ61136 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prpf4bQ61136 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms