Protein–RNA interactions for Protein: Q60931

Vdac3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac3Q60931 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vdac3Q60931 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vdac3Q60931 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vdac3Q60931 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vdac3Q60931 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vdac3Q60931 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vdac3Q60931 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms