Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Samhd1Q60710 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Samhd1Q60710 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Samhd1Q60710 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Samhd1Q60710 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Samhd1Q60710 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Samhd1Q60710 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Samhd1Q60710 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Samhd1Q60710 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Samhd1Q60710 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Samhd1Q60710 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Samhd1Q60710 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Samhd1Q60710 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Samhd1Q60710 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Samhd1Q60710 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Samhd1Q60710 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Samhd1Q60710 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Samhd1Q60710 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Samhd1Q60710 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Samhd1Q60710 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Samhd1Q60710 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Samhd1Q60710 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Samhd1Q60710 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Samhd1Q60710 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Samhd1Q60710 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Samhd1Q60710 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Samhd1Q60710 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Samhd1Q60710 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Samhd1Q60710 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Samhd1Q60710 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Samhd1Q60710 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Samhd1Q60710 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Samhd1Q60710 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Samhd1Q60710 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Samhd1Q60710 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Samhd1Q60710 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Samhd1Q60710 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Samhd1Q60710 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Samhd1Q60710 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Samhd1Q60710 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Samhd1Q60710 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samhd1Q60710 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samhd1Q60710 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Samhd1Q60710 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Samhd1Q60710 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Samhd1Q60710 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Samhd1Q60710 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Samhd1Q60710 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Samhd1Q60710 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Samhd1Q60710 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Samhd1Q60710 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms