Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SFMBT2Q5VUG0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SFMBT2Q5VUG0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SFMBT2Q5VUG0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SFMBT2Q5VUG0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SFMBT2Q5VUG0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SFMBT2Q5VUG0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SFMBT2Q5VUG0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SFMBT2Q5VUG0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SFMBT2Q5VUG0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SFMBT2Q5VUG0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SFMBT2Q5VUG0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SFMBT2Q5VUG0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SFMBT2Q5VUG0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SFMBT2Q5VUG0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SFMBT2Q5VUG0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SFMBT2Q5VUG0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SFMBT2Q5VUG0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SFMBT2Q5VUG0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SFMBT2Q5VUG0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SFMBT2Q5VUG0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SFMBT2Q5VUG0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SFMBT2Q5VUG0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SFMBT2Q5VUG0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms