Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
WDR78Q5VTH9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
WDR78Q5VTH9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
WDR78Q5VTH9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
WDR78Q5VTH9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
WDR78Q5VTH9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
WDR78Q5VTH9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
WDR78Q5VTH9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
WDR78Q5VTH9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
WDR78Q5VTH9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
WDR78Q5VTH9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
WDR78Q5VTH9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
WDR78Q5VTH9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
WDR78Q5VTH9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
WDR78Q5VTH9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
WDR78Q5VTH9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
WDR78Q5VTH9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
WDR78Q5VTH9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
WDR78Q5VTH9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
WDR78Q5VTH9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
WDR78Q5VTH9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
WDR78Q5VTH9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
WDR78Q5VTH9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
WDR78Q5VTH9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
WDR78Q5VTH9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms