Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBAP2Q5T6F2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBAP2Q5T6F2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms